Vaisiaus vandenų proteominė analizė ir biožymenų paieška
Vaisiaus vandenys yra nuostabus kompleksas ir dinaminė vaisiaus aplinka, kuri apsaugo vaisių nuo traumų bei uždegimo reakcijų, užtikrina vaisiaus augimą, savo sudėtyje turi daugybę gyvybiškai reikalingų augimo veiksnių. Nėštumo metu baltymai ir peptidai, esantys vaisiaus vandenų sudėtyje, įjungiami į skysčių cirkuliaciją ir motinos kraujotaką.Baigiamajame magistro darbe analizuojamos normalaus nėštumo žmogaus vaisiaus vandenys ir nėštumo su patologijomis (preeklampsija, polihidramnionas, trisomija, dvylikapirštės žarnos atrezija, dvynių transfuzijos sindromas ir kt.). Atliekamas šių viausaus vandenų proteomų palyginimas ir baltymų identifikavimas. Po baltymų, išskirtų iš vaisiaus vandenų ir vaisiaus vandenų ląstelių, frakcionavimo gelyje dvikryptės elektroforezės būdu buvo gauti baltymų žemėlapiai. MALDI/ TOF ir ESI/ TOF masės spektrometrijos būdu buvo identifikuoti vaisiaus vandenų baltymai. Skirtingų nėštumų vaisiaus vandenų baltymų žemėlapiai ir baltymų ekspresijos lygiai buvo analizuojami ir palyginti naudojant įviarius bioinformatikos metodus. Vaisiaus vandenų proteominė analizė leidžia identifikuoti biožymenis, kurie gali rodyti vaisiaus vystymosi arba nėštumo sutrikimus.Darbą sudaro 7 dalys: įvadas, literatūros apžvalga, medžiagos, metodai ir aparatūra, tyrimo rezultatai, rezultatų aptarimas, išvados, literatūros sąrašas. Darbo apimtis 76 p. teksto be priedų, 21 paveikslų, 12 lentelių, 57 bibliografiniai šaltiniai Atskirai pridedami darbo priedai.
Amniotic fluid (AF) is a marvelously complex mixture and it reflects the physiological and pathological status of the developing fetus and pregnancy. In this study we identified and compared proteins isolated from the human amniotic fluid and amniotic fluid' cells obtained from normal pregnancy and pregnancies with pathologies (preeclampsia, polyhydramnion, trisomia, Duodenal atresia, Twin-to-twin transfusion syndrome). Proteins isolated from amniotic and amniotic fluid stem cells were fractionated by two-dimensional gel electroforesis (2-DE), visualized by Coomassie blue staining and all visualized proteins subjected for identification with MALDI/ TOF mass spectrometry. Furthermore, amniotic fluids were examined with ESI/TOF mass spectrometry to investigate the changes of protein levels. Changes in identified protein expression levels and function defined in different status of pregnancy were analyzed by various bioinformatic tools. Proteome analysis of amniotic fluid creates the possibility of protein biomarkers in prenatal tests diagnosing fetal development and pregnancy related disorders.Structure: introduction, review of the topic and problems, methods, results, discussion, conclusion, references. Thesis consist of 76 p. text without appendixes, 21 pictures, 12 tables, 57 bibliographicial entries. Appendixes included.