Laisvos DNR panaudojimas požeminio vandens tyrimuose bei kapsuliuotos DNR sąlygų optimizavimas
Mlynska, Agata | Recenzentas / Rewiewer |
Bironaitė, Daiva | Darbo gynimo komisijos pirmininkas / Thesis Defence Board Chairman |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member |
Baigiamajame magistro darbe yra tiriama, ar yra įmanoma panaudoti laisvosios DNR sekos žymiklį Kairėnuose esančioje geologijos aikštelėje hidrogeologiniams tyrimams, ar reikia būtinai suteikti DNR sekai palankią aplinkai apsaugą. Teorinėje dalyje yra aptariami naujos kartos DNR žymiklių privalumai bei panaudojimo galimybės. Taip pat yra pateikiami kitų mokslininkų, sėkmingų eksperimentų su laisva ir kapsuliuota DNR rezultatai. Metodų dalyje yra apžvelgiamos qPGR panaudojimo galimybės bei yra parenkamos tinkamos DNR sekos bei pradmenų koncentracijos šiame darbe naudojamai DNR sekai. Analitinėje dalyje yra aprašomas Kairėnuose atlikto lauko ekperimento su laisva DNR rezultatai bei yra paruošiamos DNR kapsulės. Šioje darbo dalyje taip pat yra analizuojama koks yra DNR sekos įkapsuliavimo efektyvumas bei kokia yra kapsulių dydžio priklausomybė nuo chitozano/alginato santykio. Gauti duomenys leidžia daryti išvadą, kad laisvos DNR žymikliai nėra tinkami naudoti Kairėnų vietovėje, todėl DNR būtina kapsuliuoti. Kapsulių paruošimo metu geriausia yra pasirinkti mažesnį chitozano/alginato santykį, kad paruoštos kapsulės būtų tinkamo dydžio ir galėtų praeiti pro požeminių vandens sluoksnių poras.Darbą sudaro 5 dalys: įvadas, literatūrinė dalis, metodinė dalis, tyrimo rezultatai, išvados, darbe naudotos literatūros sąrašas.Darbo apimtis: 57 psl., 32 iliustr., 9 lent., 53 bibliografinių šaltinių.
This Master's thesis investigates if it is feasible to use a free DNA sequence tracer for hydrogeological studies at the Kairenai geological site or whether it is necessary to provide environmental friendly protection for the DNA sequence. The literature review discusses the advantages and applications of DNA tracers. The results of successful experiments with free and encapsulated DNA, which have been performed by other scientists are also presented. The methodology section reviews the use of qPCRs and the selection of appropriate DNA sequences and primer concentrations for the DNA tracer preparation for field experiment. The analytical part describes the results of the field experiment with free DNA, which has been performed in Kairenai and the preparation of the DNA capsules. In this part of the work, the efficiency of the DNA sequence encapsulation and the dependence of the capsule size on the chitosan/alginate ratio are also analysed. The results of studies obtained lead to the conclusion that free DNA markers are not suitable for use in the Kairenai area and that is necessary to encapsulate the DNA. It is best to choose a lower chitosan/alginate ratio for the preparation of the capsules, it helps to prepare capsules of the right size to pass through the pores of the groundwater aquifers.Thesis structure: introduction, literature review, methodology, results and discussion, conclusions, references.Thesis consists of: 57 p. text without appendices, 32 pictures, 9 tables, 53 bibliographical entries