Nukleotidų sekų statistinių savybių pateikimas grafų teorijos terminais
Baigiamajame magistro darbe nagrinėjamos bakterijų genomų nekoduojančios nukleotidų sekos. Darbe aprašomos nekoduojančių nukleotidų sekų savybės. Darbe nukleotidų sekos analizuojamos naudojant grafų teorijos metodus ir logtiesinę regresiją. Buvo tiriamas nukleotidų sekų nepriklausomumas, bandoma pagrįsti faktą, kad net ir nekoduojančios sekos nėra nepriklausomos. Gauti logtiesiniai modeliai klasterizuojami taip bandant išskriti tipinius ir išsiskiriančius modelius. Praktinės dalies įgyvendinimui buvo naudojama statistinė programa R ir įvairūs jos paketai. Darbą sudaro 6 dalys: įvadas, teorinė dalis, tiriamoji dalis, išvados, literatūros sąrašas, priedai. Darbo apimtis - 36 p. teksto be priedų, 40 iliustracijų, 7 lentelės, 14 bibliografinių šaltinių. Atskirai pridedamas darbo priedas.
The master thesis investigates non-coding nucleotide sequences of bacteria genome. This paper analyses nucleotide sequences properties. Nucleotide sequences were analyzed using graph theory and loglinear models. In this paper independence of nucleotide sequences was analyzed and one was trying to prove that even non-coding nucleotide sequences are non-independent. All loglinear models were clusterized, main types and exclusions were identified. The data is further analised using R statistical progam and additionally provided packages. The thesis is split into 6 parts: introduction, theory overview, empirical research, conclusions, bibliography, annexes. Thesis's volume - 36 pages of content without annexes, 40 pictures, 7 tables, 14 bibliography items. Annexes are presented separately.