Protelomerazių tyrimai ir jų taikymas DNR konstruktų technologijai
Tauraitė, Daiva | Recenzentas / Rewiewer |
Bironaitė, Daiva | Darbo gynimo komisijos pirmininkas / Thesis Defence Board Chairman |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member | |
Darbo gynimo komisijos narys / Thesis Defence Board Member |
Protelomerazės (dar vadinamos telomerų rezolvazėmis) yra įdomi ir unikali fermentų klasė, atsakinga už linijinės DNR (kai kurių fagų, bakterijų plazmidžių ir bakterijų chromosomų) uždarų plaukų segtukų susidarymą. Šis baltymas sugeba spręsti pabaigos replikacijos problemas ir geba uždaryti laisvus ir atvirus DNR molekulės galus. Formuodami telomerines struktūras linijinių plazmidžių galuose, fermentai apsaugo genetinę medžiagą nuo degradacijos egzonukleazėmis ir pažeidžiamumo, todėl tikimasi, kad šios struktūros bus stabilios. Be to, replikuojant šias sritis nėra prarandama informacija iš 5' galo, nes šis baltymas gali pertvarkyti tikslinę sritį, nepridėdamas ar nepašalindamas nukleotidų. Iki šiol telomerų rezolvazės identifikuotos ir apibūdintos septyniose bakterijų rūšyse ir trijuose faguose. Nepaisant to, protelomerazės tebėra menkai apibūdintos, o klausimai apie jų struktūrą, funkciją, mechanizmą ir evoliucijos istoriją lieka neatsakyti. Šio tyrimo tikslas - apibūdinti protelomerazės fermentus ir jų tinkamumą DNR konstruktams kurti.Darbą sudaro 6 dalys: įvadas, literaūros apžvalga, metodika, rezultatai ir jų aptarimas, išvados ir literatūros sąrašas. Darbo apimtis - 75 p. teksto be priedų, 28 iliustr., 30 lent., 109 bibliografiniai šaltiniai. Atskirai pridedami darbo priedai.
Protelomerases (known as telomere resolvases) are an interesting and unique class of enzymes that are responsible for generating closed hairpin ends in linear DNA (some phages, bacterial plasmids, and bacterial chromosomes). This protein is known as a unique key to the end replication problem for its ability to close DNA molecule-free or open ends. In forming telomeric structures at the ends of linear plasmids, enzymes protect the genetic material from exonuclease degradation and vulnerability and are expected to make structures stable. In addition, such ends are replicated without loss of information from 5' end, because this protein can rearrange the target site without adding or deleting nucleotides. To date, telomere resolvases have been identified and characterized in seven bacterial species and three phages. Despite this, protelomerases remain poorly characterized and questions about their structure, function, mechanism, and evolutionary history remain unanswered. The purpose of this research is to characterize protelomerase derivatives and their suitability for creating DNA constructs.Structure: introduction, literature review, methodology, results, conclusions, references.Thesis consist of: 75 p. text without appendixes, 28 pictures, 30 tables, 109 references.Appendixes included.